背景介绍:
蛋白质组学研究可根据其研究焦点是否特定于某类蛋白质而划分为靶向蛋白质组学与非靶向蛋白质组学两个分支。靶向蛋白质组学分析是一种专注于特定蛋白质或蛋白质组的研究方法,通过选择性地检测和定量目标蛋白质,提供高灵敏度和高特异性的结果,用于深入研究蛋白质功能和疾病机制。相较于非靶向蛋白质组学,靶向蛋白质组学在准确度、灵敏度和重现性方面均展现出更为优越的性能,为蛋白质组学的深入研究提供了更为精准和可靠的工具。
此外,绝对定量分析是蛋白质组学领域中至关重要的技术手段,专门用于精确测定蛋白质或肽段在样本中的浓度或拷贝数。这一方法的核心在于利用已知浓度的标准品(通常为同位素标记肽段)进行精确校准。绝对定量分析对于基础生物学研究及临床应用具有重要意义,它不仅能够提供更准确的蛋白质表达信息,还有助于建立蛋白质丰度数据库,从而深化对生理过程和病理状况下蛋白质功能的理解。
技术优势:
① 专业技术优势:公司拥有先进的质谱平台和资深专业团队,提供全面、精准的非靶向与靶向蛋白质组学服务。
② 丰富服务选项:涵盖多种靶向定量技术(PRM),满足不同研究需求。可根据客户需求定制实验方案,保障最优实验效果。
③ 严谨质量管理:成熟质量管理体系,遵循ISO9001标准,确保报告真实可信。
④ 从咨询到报告交付,全程及时反馈进度,确保客户的满意度与项目的高效执行。
服务内容:
技术平台:
ju11net九州体育生物提供基于质谱技术的靶向与绝对定量蛋白质组学分析服务,旨在为客户提供全面且深入的蛋白质研究支持。
在靶向蛋白质组学范畴内,ju11net九州体育采用PRM(parallel reaction monitoring)作为核心技术手段。PRM能够极其敏感地检测到低丰度的多肽片段,有效排除背景蛋白干扰,并实现高精度定量,从而有效验证和确认非靶向蛋白质组学所揭示的生物学差异相关蛋白质。
与传统的靶向蛋白质定量方法(如Western blot)相比,靶向蛋白质组学方法无需发展抗体,可一次性检测多个蛋白,必要时可实现绝对定量。
案例展示:
项目需求:为了深入探究药物处理组与对照组细胞样品中,药物与某些特定关注蛋白的结合位点,以揭示与药物表型相关的分子机制。我们采用基于PRM技术的靶向定量蛋白质组学方法,处理每组两次生物学重复的样本,实现对差异结合位点的精确鉴定和定量分析。
数据展示:塞利尼索(Selinexor, KPT330)通过共价结合抑制核蛋白输出1(XPO1_C528_LVVVGAC*GVGK)活性从而治疗多发性骨髓瘤和弥漫性大B细胞淋巴瘤。我们利用不同浓度KPT330处理HCT116细胞,采用高分辨质谱技术,实现了对目标母离子的全面、精确的二级质谱信息捕获。这种技术使得我们能够选择性地、精确地检测目标蛋白和肽段。发现在1 μM 条件下,KPT330对XOP1_C528位点占据率即可接近100%,并且通过拟合曲线发现,细胞内位点结合能力EC50为241nM,与KPT330细胞抑制活性IC50(150-500nM)相当。